Das große Talent von Dakota Fanning zeigt sich auch daran, dass sie seit 2002 bisher jedes Jahr in verschiedenen Kategorien für den Young Artist Award nominiert wurde. Zwei Mal konnte sie diese Auszeichnung dabei schon gewinnen.
Young Artist Award 2002: Beste Darstellung in einem Spielfilm - Schauspieler bis 10 Jahre für Ich bin Sam - Gewinnerin
Young Artist Award 2003: Beste junge Hauptdarstellerin in einem Fernsehfilm, Mini-Serie oder Special für Taken - Nominierung
Young Artist Award 2004: Beste junge Hauptdarstellerin in einem Spielfilm für Ein Kater macht Theather - Nominierung
Young Artist Award 2005: Beste junge Hauptdarstellerin in einem Spielfilm für Mann unter Feuer - Nominierung
Young Artist Award 2006: Beste junge Hauptdarstellerin in einem Spielfilm für Dreamer – Ein Traum wird wahr - Gewinnerin
Neben den Young Artist Award wurde Fanning noch von zahlreichen weiteren Organisationen für verschiedene Preise nominiert. Unter anderem gewann sie den BFCA-Award als Beste junge Schauspielerin im Jahr 2002 für Ich bin Sam und 2006 für Krieg der Welten (War of the worlds).